主任在管委會領導下全面負責制定并實施中心的規劃、研發和經營計劃、項目管理等工作。

研發部：在主任領導下負責制定并實施中心的研發計劃。

技術部：在主任領導下負責中心研發技術（產品）成果的產業化工作。

財務部：負責年度計劃、月度計劃、周資金計劃的編制，監督各項與費用相關制度的落實，負責款項的收付及成本核算工作。

市場部：在主任領導下負責中心產業化技術（產品）的推廣應用和項目管理，以及其它市場經營活動。

行政部：在主任領導下負責中心行政、財務、人事、公關、聯絡等工作。

培訓中心：負責工程中心人才培養，對外技術交流，講座工作，搞好學術研討，收集消能阻尼器關鍵技術的科技情況信息。